当院は、明治２２年（１８８９年）藤森亀太郎が松本病院として現在地（当時は、東筑摩郡松本町）に開院しました。開院当時、松本市には医療機関が少なく、医療に恵まれない時代であり、重病に苦しみながら、手当てを受けることすらできない人々が多くありました。初代院長は、近隣の開業医の協力を得ながら、地域医療に貢献しました。当院の理念として、「地域のかかりつけ病院として、やさしさ、こころ遣いのある病院を目指します」とありますが、これは開院以来の当院の伝統です。
その後、大正１４年（１９２５年）に私立松本病院（現在の信州大学病院）が設立されることになり、藤森病院と改称しました。昭和２６年（１９５１年）には、医療充実強化を目的に医療法人藤森病院と改組し、昭和４９年（１９７４年）には、開院８５周年を兼ねて新築工事を行いました。また、初代院長藤森亀太郎は外科医であり、現院長まで（第７代目）院長は代々外科医が務め、外科専門病院として歩んできましたが、平成７年（１９９５年）には、内科医が常勤体制となりました。
近年、施設の老朽化が進み、先端医療に対応し、患者様に良好な医療環境を提供することが困難になりました。平成２０年春から開院１２０周年に向けて、病院の全面改築工事を開始し、平成２１年末には新病院完成の予定です。
当院をご利用いただく患者様には、満足のいく医療を提供し、職員には、職務満足が高く、医療人としての責任のもと、自信と誇りを持って働くことのできる病院として努力していく所存です。今後とも地域の病院として、一層地域の皆様のお役にたてるよう、職員全員が一丸となってがんばってまいりますので、皆様の御協力、御支援をよろしくお願い致します。
医療法人藤森医療財団 藤森病院
理事長 藤森芳史
